GCA_016900715.1 - 2 region(s) - gutSMASH results

Identified primary metabolite regions

JACJKI010000019 (original name was: JACJKI010000019.1)

Region	Type	Class	From	To	Most similar known cluster		Similarity
Region 39.1	TPP_AA_metabolism	Putative	1	27,562

JACJKI010000026 (original name was: JACJKI010000026.1)

Region	Type	Class	From	To	Most similar known cluster		Similarity
Region 47.1	Nitrate_reductase	E-MGC	1	22,243	Nitrate reductase E. coli	NIR	40%

No primary metabolite regions were found in these records:: JACJKI010000001 (original name was: JACJKI010000001.1); JACJKI010000002 (original name was: JACJKI010000002.1); JACJKI010000011 (original name was: JACJKI010000011.1); JACJKI010000101 (original name was: JACJKI010000101.1); JACJKI010000102 (original name was: JACJKI010000102.1); JACJKI010000103 (original name was: JACJKI010000103.1); JACJKI010000104 (original name was: JACJKI010000104.1); JACJKI010000105 (original name was: JACJKI010000105.1); JACJKI010000106 (original name was: JACJKI010000106.1); JACJKI010000107 (original name was: JACJKI010000107.1); JACJKI010000108 (original name was: JACJKI010000108.1); JACJKI010000109 (original name was: JACJKI010000109.1); JACJKI010000110 (original name was: JACJKI010000110.1); JACJKI010000012 (original name was: JACJKI010000012.1); JACJKI010000111 (original name was: JACJKI010000111.1); JACJKI010000112 (original name was: JACJKI010000112.1); JACJKI010000113 (original name was: JACJKI010000113.1); JACJKI010000114 (original name was: JACJKI010000114.1); JACJKI010000115 (original name was: JACJKI010000115.1); JACJKI010000116 (original name was: JACJKI010000116.1); JACJKI010000117 (original name was: JACJKI010000117.1); JACJKI010000118 (original name was: JACJKI010000118.1); JACJKI010000119 (original name was: JACJKI010000119.1); JACJKI010000120 (original name was: JACJKI010000120.1); JACJKI010000013 (original name was: JACJKI010000013.1); JACJKI010000121 (original name was: JACJKI010000121.1); JACJKI010000122 (original name was: JACJKI010000122.1); JACJKI010000123 (original name was: JACJKI010000123.1); JACJKI010000124 (original name was: JACJKI010000124.1); JACJKI010000125 (original name was: JACJKI010000125.1); JACJKI010000126 (original name was: JACJKI010000126.1); JACJKI010000127 (original name was: JACJKI010000127.1); JACJKI010000128 (original name was: JACJKI010000128.1); JACJKI010000014 (original name was: JACJKI010000014.1); JACJKI010000015 (original name was: JACJKI010000015.1); JACJKI010000016 (original name was: JACJKI010000016.1); JACJKI010000017 (original name was: JACJKI010000017.1); JACJKI010000018 (original name was: JACJKI010000018.1); JACJKI010000020 (original name was: JACJKI010000020.1); JACJKI010000003 (original name was: JACJKI010000003.1); JACJKI010000021 (original name was: JACJKI010000021.1); JACJKI010000022 (original name was: JACJKI010000022.1); JACJKI010000023 (original name was: JACJKI010000023.1); JACJKI010000024 (original name was: JACJKI010000024.1); JACJKI010000025 (original name was: JACJKI010000025.1); JACJKI010000027 (original name was: JACJKI010000027.1); JACJKI010000028 (original name was: JACJKI010000028.1); JACJKI010000029 (original name was: JACJKI010000029.1); JACJKI010000030 (original name was: JACJKI010000030.1); JACJKI010000004 (original name was: JACJKI010000004.1); JACJKI010000031 (original name was: JACJKI010000031.1); JACJKI010000032 (original name was: JACJKI010000032.1); JACJKI010000033 (original name was: JACJKI010000033.1); JACJKI010000034 (original name was: JACJKI010000034.1); JACJKI010000035 (original name was: JACJKI010000035.1); JACJKI010000036 (original name was: JACJKI010000036.1); JACJKI010000037 (original name was: JACJKI010000037.1); JACJKI010000038 (original name was: JACJKI010000038.1); JACJKI010000039 (original name was: JACJKI010000039.1); JACJKI010000040 (original name was: JACJKI010000040.1); JACJKI010000005 (original name was: JACJKI010000005.1); JACJKI010000041 (original name was: JACJKI010000041.1); JACJKI010000042 (original name was: JACJKI010000042.1); JACJKI010000043 (original name was: JACJKI010000043.1); JACJKI010000044 (original name was: JACJKI010000044.1); JACJKI010000045 (original name was: JACJKI010000045.1); JACJKI010000046 (original name was: JACJKI010000046.1); JACJKI010000047 (original name was: JACJKI010000047.1); JACJKI010000048 (original name was: JACJKI010000048.1); JACJKI010000049 (original name was: JACJKI010000049.1); JACJKI010000050 (original name was: JACJKI010000050.1); JACJKI010000006 (original name was: JACJKI010000006.1); JACJKI010000051 (original name was: JACJKI010000051.1); JACJKI010000052 (original name was: JACJKI010000052.1); JACJKI010000053 (original name was: JACJKI010000053.1); JACJKI010000054 (original name was: JACJKI010000054.1); JACJKI010000055 (original name was: JACJKI010000055.1); JACJKI010000056 (original name was: JACJKI010000056.1); JACJKI010000057 (original name was: JACJKI010000057.1); JACJKI010000058 (original name was: JACJKI010000058.1); JACJKI010000059 (original name was: JACJKI010000059.1); JACJKI010000060 (original name was: JACJKI010000060.1); JACJKI010000007 (original name was: JACJKI010000007.1); JACJKI010000061 (original name was: JACJKI010000061.1); JACJKI010000062 (original name was: JACJKI010000062.1); JACJKI010000063 (original name was: JACJKI010000063.1); JACJKI010000064 (original name was: JACJKI010000064.1); JACJKI010000065 (original name was: JACJKI010000065.1); JACJKI010000066 (original name was: JACJKI010000066.1); JACJKI010000067 (original name was: JACJKI010000067.1); JACJKI010000068 (original name was: JACJKI010000068.1); JACJKI010000069 (original name was: JACJKI010000069.1); JACJKI010000070 (original name was: JACJKI010000070.1); JACJKI010000008 (original name was: JACJKI010000008.1); JACJKI010000071 (original name was: JACJKI010000071.1); JACJKI010000072 (original name was: JACJKI010000072.1); JACJKI010000073 (original name was: JACJKI010000073.1); JACJKI010000074 (original name was: JACJKI010000074.1); JACJKI010000075 (original name was: JACJKI010000075.1); JACJKI010000076 (original name was: JACJKI010000076.1); JACJKI010000077 (original name was: JACJKI010000077.1); JACJKI010000078 (original name was: JACJKI010000078.1); JACJKI010000079 (original name was: JACJKI010000079.1); JACJKI010000080 (original name was: JACJKI010000080.1); JACJKI010000009 (original name was: JACJKI010000009.1); JACJKI010000081 (original name was: JACJKI010000081.1); JACJKI010000082 (original name was: JACJKI010000082.1); JACJKI010000083 (original name was: JACJKI010000083.1); JACJKI010000084 (original name was: JACJKI010000084.1); JACJKI010000085 (original name was: JACJKI010000085.1); JACJKI010000086 (original name was: JACJKI010000086.1); JACJKI010000087 (original name was: JACJKI010000087.1); JACJKI010000088 (original name was: JACJKI010000088.1); JACJKI010000089 (original name was: JACJKI010000089.1); JACJKI010000090 (original name was: JACJKI010000090.1); JACJKI010000010 (original name was: JACJKI010000010.1); JACJKI010000091 (original name was: JACJKI010000091.1); JACJKI010000092 (original name was: JACJKI010000092.1); JACJKI010000093 (original name was: JACJKI010000093.1); JACJKI010000094 (original name was: JACJKI010000094.1); JACJKI010000095 (original name was: JACJKI010000095.1); JACJKI010000096 (original name was: JACJKI010000096.1); JACJKI010000097 (original name was: JACJKI010000097.1); JACJKI010000098 (original name was: JACJKI010000098.1); JACJKI010000099 (original name was: JACJKI010000099.1); JACJKI010000100 (original name was: JACJKI010000100.1)

Compact view

c00039_JACJKI0.. - Region 1 - TPP_AA_metabolism

Download region GenBank file

Location: 1 - 27,562 nt. (total: 27,562 nt) Show pHMM detection rules used

Region on contig edge.

TPP_AA_metabolism: (TPP_enzyme_C and not (PFL-like or PFL_6_pcresol or PFL_9_tma or Gly_radical or Gly_430_pcre or Gly_8-9_TMA or PFL_acetate1 or PFL_acetate2 or Gly_radical_scatole or PFL_proline or PFL_toluene) and minimum(2, [ALS_ss_C, AlaDh_PNT_C, Arginase, BKACE, BcrAD_BadFG, Beta_elim_lyase, CPSase_L_D2, Cys_Met_Meta_PP, ELFV_dehydrog, GRDB, Glu_syn_central, Glu_synthase, Gly_reductase, HAAA1, HG2B1, HG2B2, HGD-D, HleuD1, HleuD2, HleuS1, HleuS2, Homoserine_dh, ILVD_EDD, IlvC, Lactoyl-CoA1, Lactoyl-CoA2, Lyase_aromatic, MAAL_C, OKR_DC_1_5_lysine, OKR_DC_1_5_ornithine, OKR_DC_1_7_arginine, OKR_DC_1_C, OTCace, PALP, Proline_reductase, Sacchrp_dh_C, TPL, Thr_dehydrat_C, TnaA, Urocanase]) and not (POR or POR_N or PFOR_II))

Legend:

core biosynthetic genes

additional biosynthetic genes

transport-related genes

regulatory genes

resistance genes

encapsulation genes

electron transport genes

other genes

reset view

zoom to selection

Gene details

Select a gene to view the details available for it

KnownClusterBlast

Similar known gene clusters

No matches found.

c00047_JACJKI0.. - Region 1 - Nitrate_reductase

Download region GenBank file

Location: 1 - 22,243 nt. (total: 22,243 nt) Show pHMM detection rules used

Region on contig edge.

Nitrate_reductase: (Nitr_red_bet_C and Nitrate_red_del and Nitrate_red_gam and Molybdopterin and minimum(2, [Fer4_11, Molybdopterin, Molydop_binding, Nitr_red_alph_N]))

Legend:

core biosynthetic genes

additional biosynthetic genes

transport-related genes

regulatory genes

resistance genes

encapsulation genes

electron transport genes

other genes

reset view

zoom to selection

Gene details

Select a gene to view the details available for it

KnownClusterBlast

Similar known gene clusters